次官
第一次官 イーゴリ・マニロフ
次官兼国家書記(官房長)アレクサンドル・ペトリコフ
次官 オレグ・アルドシン、セルゲイ・レヴィン、パーヴェル・セミョーノフ、アレクサンドル・チェルノゴロフ、イリヤ・シェスタコフ、ドミトリー・ユリエフ
中央部局
連邦農業省には、本省に以下の部局(Департамент)が設置されています。
農業食糧市場規制・漁業・食品加工業局
行政管理・組織局
農村開発・社会政策局
公務員・人事政策局
科学技術政策・教育局
法務・支援局
土地政策・不動産関係・国有財産局
金融・財政政策局
経済・分析局
工場・化学・植物保護局
干拓局
畜産・繁殖局
獣医学局
国際協力局
外局
連邦獣医植物検疫監督庁(ロッセリホスナズドゾル)
連邦漁業庁(ロスリュボロフストヴォ)